新药创制与绿色合成研究所的研究方向包括重大疾病相关药物的设计合成和作用机制研究、具有生物活性物质的绿色合成、天然产物的分离和全合成、药物的新合成工艺及其质量标准开发、新型智能递送系统等。目前在任所长梁建华、书记尹宏权、副所长于明加、教学主任张奇。其中梁建华和陈甫雪兼任医药分子科学与制剂工程工信部重点实验室的副主任。负责和参与建设一级药学博士点、化学工程与技术博士点、制药工程博士点以及国家一流本科专业“制药工程”。近些年在Nat Chem Biol、J Med Chem、Cell Discov、Euro J Med Chem、J Agri Food Chem、J Org Chem、Org Lett等期刊发表数十篇高水平论文。